लिस्बन और पोर्टो के बाद, कोयम्ब्रा पुर्तगाल के सबसे महत्वपूर्ण शहरों में से एक है। मध्य पुर्तगाल की राजधानी के रूप में इसने महत्वपूर्ण भूमिका निभाई। कोयम्ब्रा में रोमन काल के कुछ रोचक पुरातात्विक अवशेष मौजूद हैं, जब यह शहर एमिनियम के नाम से जाना जाता था। बाद में ही इस शहर का काफी विस्तार हुआ और इसका नाम पास के कोनिम्ब्रीगा से जुड़ गया।
कोइम्ब्रा को 878 में मूरों से जीत लिया गया था, लेकिन एक सदी बाद यह शहर फिर से मूरों के हाथों में चला गया। अंततः 1064 में कैस्टिले के फर्डिनेंड द ग्रेट ने शहर को मुक्त कराया। जब पहले पुर्तगाली राजा अफोंसो हेनरिकेस ने 1139 में राजधानी को गुइमारेस से दक्षिण की ओर स्थानांतरित करने का निर्णय लिया, तो कोइम्ब्रा को चुना गया। कोइम्ब्रा ने 1139 से 1260 तक पुर्तगाल की राजधानी के रूप में कार्य किया और शीघ्र ही एक महत्वपूर्ण सांस्कृतिक केंद्र के रूप में विकसित हुआ। इसका श्रेय काफी हद तक इसके विश्वविद्यालय को जाता है, जिसकी स्थापना 1290 में हुई थी और यह यूरोप के सबसे पुराने विश्वविद्यालयों में से एक है। मूल रूप से लिस्बन में स्थापित यह विश्वविद्यालय 1537 में कोइम्ब्रा में स्थानांतरित हो गया और अब राजा अफोंसो के पूर्व महल में स्थित है। यह शहर छह राजाओं का जन्मस्थान भी है। शहर में उस काल और उसके बाद के कई महत्वपूर्ण स्मारक हैं, और इसकी ऐतिहासिक रूप से समृद्ध भव्य इमारतें दुनिया भर से पर्यटकों को आकर्षित करती हैं।
