Nakon Lisabona i Porta, Coimbra je jedan od najvažnijih gradova u Portugalu. Igrala je vitalnu ulogu kao glavni grad središnjeg Portugala. Coimbra se može pohvaliti nekim zanimljivim arheološkim ostacima koji datiraju još iz vremena rimskog grada, poznatog kao Aeminium. Tek kasnije grad se značajno proširio i dobio ime obližnja Conímbriga.
Coimbra je osvojena od Maura 878. godine, ali stoljeće kasnije grad je ponovno pao u maurske ruke. Grad je konačno oslobođen 1064. godine od strane Ferdinanda Velikog od Kastilje. Kada je Afonso Henriques, prvi portugalski kralj, odlučio preseliti glavni grad iz Guimarãesa na jug 1139. godine, odabrana je Coimbra. Coimbra je služila kao glavni grad Portugala od 1139. do 1260. godine i brzo se razvila u važno kulturno središte. To je uglavnom bilo zahvaljujući sveučilištu, osnovanom 1290. godine, jednom od najstarijih u Europi. Izvorno osnovano u Lisabonu, sveučilište se preselilo u Coimbru 1537. godine i smješteno je u bivšoj palači kralja Afonsa. Grad je ujedno i rodno mjesto šest kraljeva. Grad se može pohvaliti mnogim važnim spomenicima iz tog razdoblja i šire, a njegove monumentalne građevine, prožete poviješću, privlače turiste iz cijelog svijeta.